Pierwsze budynki szpitala zostały zbudowane w 1917 roku, jako Miejskie Zakłady Sanitarne. Jedną z pacjentek tego miejsca była Św. Siostra Faustyna Kowalska. W 1948 roku zmieniono nazwę placówki na Wojewódzki Szpital Specjalistyczny im. dr Anki. Obecna Poliklinika Kardiologiczna została zbudowana przez Fundację „Cor Aegrum”. W 1990 roku nadano szpitalowi imię Jana Pawła II, zaś siedem lat później papież osobiście go poświęcił.
Na terenie szpitala znajduje się powstała w 1917 roku kaplica pw. Najświętszego Serca Pana Jezusa, w której jako pacjentka placówki przez kilka miesięcy w latach 1936-1938 modliła się św. Faustyna Kowalska – beatyfikowana 18 IV 1983 r., a następnie kanonizowana 30 IV 2000 roku przez Ojca Świętego Jana Pawła II.
W kaplicy znajduje się klęcznik z którego, według przekazów, często korzystała św. Faustyna Kowalska oraz relikwiarz z relikwiami świętej.